Présentation

Le Centre National de Référence (CNR) de Liège est principalement dédié à la surveillance des mycoses superficielles, notamment des dermatophytoses. Par ailleurs, il a pour mission principale l’identification des champignons envoyés au CNR afin de confirmer l’identification au niveau de l’espèce. 
Lorsque cela est nécessaire, il peut également réaliser la détermination de la sensibilité in vitro des levures et des dermatophytes aux antifongiques appropriés. La sensibilité des champignons filamenteux hors dermatophytes est assurée par le CNR de la KUL.

En outre, dans le cadre de foyers épidémiques, le CNR Liège peut apporter une assistance pour la caractérisation phénotypique et génotypique des souches impliquées. Cela a été rendu possible grâce à l’utilisation du séquençage de nouvelle génération (NGS), qui permet le séquençage complet du génome fongique. 

Le CNR joue également un rôle dans la diffusion d’informations auprès des cliniciens ainsi que des scientifiques concernant les tendances émergentes dans les dermatophytoses.

Le CNR pour les Mycoses est accrédité BELAC (ISO 15189).

Missions générales et spécifiques

  • Le Centre National de Référence pour les Mycoses du CHU de Liège a pour mission l’expertise et la surveillance épidémiologique et microbiologique des mycoses superficielles
  • Identification des champignons  filamenteux et de levures  adressés par les laboratoires belges
  • Réalisation d’antifongigrammes dans le cas de dematophytose étendue (suspicion de T. indotineae) ou récalcitrante au traitement
  • Constitution et entretien de la collection de souches de dermatophytes (CNR Mycoses Liège)
  • Mise au point et développement de nouvelles méthodes de diagnostic,  d’identification et de typage moléculaire des champignons, telles que les méthodes d’amplification génique et de séquençage moléculaire
  • Alerte des autorités sanitaires à l’exemple de l’émergence de nouvelles résistances aux antifongiques ou de l’apparition d’une souche épidémique dans une population particulière
  • Activité de conseil auprès des autorités sanitaires, des médecins et des biologistes
  • Participation à des groupes d’experts à travers l’Europe
  • Valorisation des travaux par des publications, articles scientifiques, guide de prescription, formations continues
  • Activités de recherche et d’études en collaboration avec d’autres équipes scientifiques
  • Participation à des contrôles de qualité externe

Activités

Collection de souches

Le CNR Liège possède une collection importante de dermatophytes du genre Trichophyton, Microsporum ou Epidermophyton. Une collection de levures et d'autres champignons filamenteux est également disponible.

Activités de conseils

Le CNR assure une activité de conseil auprès des cliniciens et microbiologistes confrontés à des patients atteints de mycoses invasives ou superficielles. Pour toute question, le personnel du CNR est disponible par email ou par téléphone (Voir coordonnées de contact).

Tests d’identification (microscopie, Maldi-Tof, PCR, séquençage moléculaire)

Analyse morphologique incluant l'observation de l'aspect macroscopique et des caractéristiques microscopiques. Analyse génotipique incluant l'analyse des séquences nucléotidiques d’une ou plusieurs régions après extraction d’ADN si l'identification macro/microscopique est non concluante. Identification en spectrométrie de masse Maldi-Tof (analyse des protéines totales) pour les levures et certains champignons filamenteux.

Délai de réponse : 1 jour (minimum) à 3 semaines (maximum)

Tests de sensibilité in vitro (microdilution en milieu liquide et/ou Etest)

Détermination des profils de sensibilité aux antifongiques par une méthode de microdilution en milieu liquide (Sensititre). Les concentrations minimales inhibitrices (CMI) de l’amphotéricine B, 5-fluorocytosine, anidulafungine, fluconazole, itraconazole, voriconazole, posaconazole, caspofungine, et micafungine sont déterminées grâce à cette méthode.

Délai de réponse : Levures 4 jours ouvrables, champignon filamenteux 7 jours ouvrables.

PCR pour l’identification de moisissures dans des échantillons positifs en microscopie et négatifs en culture

Test réalisé uniquement pour des cas d'infection fongique invasive ou cliniquement pertinente.

Délai de réponse :1 à 4 semaines.

Typage de souches (dans un contexte épidémique)

Séquençage et/ou technique Diversilab (analyse des empreintes d'ADN par rep-PCR).

Délai de réponse : 1 à 4 semaines.

Assurance qualité

Le laboratoire de Microbiologie clinique du CHU de Liège a mis en place une démarche d’accréditation du laboratoire depuis quelques années. La démarche retenue pour mettre en conformité le CNR avec la norme ISO 15189 est fondée sur la rédaction de procédures pour chaque analyse proposée par le CNR, la création d’un dossier de validation complet pour chacune de ces techniques et un état des lieux des procédures et protocoles existants. La démarche consiste également en la mise en conformité des locaux et appareillages dédiés aux activités du CNR.

L’accréditation ISO 15189 a été octroyée au CNR mycoses à la suite de l’audit BELAC de mai 2013 (BELAC 128 MED).

Equipe & contact

Responsable

Responsable scientifique

Scientifique associée au CNR

Equipe technique

  • Rajae Darfouf
  • Quentin Legras
  • Setareh Ghambari
  • Sandrine Michaux

Secrétaires